يرى المتابع والمطلع على الشأن الاكاديمي ان جامعة البلقاء التطبيقية تتصدر المشهد الاكاديمي بالمشاكل والخلافات التي تعصف بها وبطلبتها واسهمت في تعكير صفو العملية الدراسية عدة مرات واشغلت المجتمع البلقاوي والاكاديمي والطلابي .
البلقاء التطبيقية وهي من اقدم الجامعات الاردنية واكثرها انتشاراً على مستوى المملكة حيث تكاد لا تخلو محافظة من وجود كلية تتبع لجامعة البلقاء ، مؤخراً حدث خلاف بين (27) طالباً من طلبة كلية الطب اثر تعديل نظام احتساب العلامات وسبقها خروج النائب معتز ابو رمان بخبر الاعتداء عليه من قبل موظفي الجامعة .
الاحداث والمشاكل التي شهدتها الجامعة كفيلة بتحطيم الرقم القياسي لعام 2019 كاكثر جامعة تشهد مشاكل وخلافات واعتصامات طلابية من بين الجامعات الاردنية وهو ما يفتح الباب للسؤال عن الاسباب والداوفع ومواطن الخلل في الجامعة عن دون سواها أهي في الادارة ام الطلبة ام اسباب اخرى؟ .
كثيرة هي الاخبار التي تم تداولها عن الجامعة فمنها تعاقد الجامعة مع شركة تركية غير مسجلة في دائرة مراقبة الشركات الاردنية والتعيينات وحادثة فصل الطلبة ويبقى السؤال .. ما الذي يحدث في الجامعة ؟ ولماذا تتصدر الجامعة واجهة المشكلات والخلافات عن دون الجامعات الاردنية وكأنها كالقنبلة الموقوتة ؟.