نشرت صحيفة يديعوت أحرونوت نقاط الخلاف في صفقة التبادل وتاليا ابرزها : 

- موعد انتهاء المفاوضات بشأن وقف إطلاق النار الدائم.

- هل سينسحب الجيش من محوري فيلادلفيا ونيتساريم؟

- هل ستتوقف الطلعات الجوية للجيش الإسرائيلي لجمع معلومات استخباراتية أثناء المفاوضات؟

- مفاتيح تبادل الجثث مقابل الأسرى الفلسطينيين، وكذلك الجنود مقابل الأسرى.

- إلى أين سيذهب أسرى المؤبدات المحررون من الضفة الغربية، فإسرائيل تريد إبعادهم إلى غزة أو الخارج وحماس ترفض.

- السلطة في غزة: من سيوزع المساعدات في المرحلة الأولى من الصفقة؟ ومن سيحكم بدل حماس؟ ومن سيدير إعمار غزة الذي سيبدأ في المرحلة الثالثة؟

- شروط إنهاء الحرب: ستطالب إسرائيل بحق الرد على أي خرق من حماس.

- هل سيتمكن النازحون من الوصول إلى المنطقة العازلة على حدود القطاع؟